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加拿大Allumiqs(Proteoform)样品制备工具对蛋白质组学工作流的改变

来源:仪器百科2026/8/19 9:51:573
导读:
  蛋白质组学质谱分析,结果好坏很大程度取决于前期样品制备环节,传统沉淀、移液、离心的操作流程,步骤繁琐,多次转管会造成目标蛋白损失,低丰度蛋白很容易在处理过程丢失,质谱难以检出,加拿大Allumiqs(Proteoform)样品制备工具针对蛋白样本前处理流程做出优化,适配生物质谱的上游制备需求。
  1,传统蛋白样品处理流程存在多处现实短板。常规蛋白沉淀方法,需要反复移液、离心、弃上清,多步管内转移,每一步操作都会带来样本损耗,低丰度目标蛋白损失之后,质谱就无法识别。同时部分生物样本含有高浓度去污剂,这类物质会干扰后续质谱电离过程,抑制肽段信号,想要去除去污剂,又会额外增加处理步骤,进一步加剧蛋白损失,对于血浆、组织裂解液这类复杂样本,矛盾会更加突出。
  2,该样品制备工具把多个实验步骤收拢至单一耗材单元内部完成。沉淀、过滤、蛋白酶解可以在同一个装置中顺序开展,减少样本在不同离心管之间来回转移,降低移液操作带来的样本丢失,提升低丰度蛋白的回收概率。样本从生物流体到酶解产物,整套流程的操作环节得到简化,也减少人为操作带来的批次差异,有利于多组样本平行比对实验,提升组和组之间结果的可对比程度。
  3,样本起始量的适配范围拓展,对珍贵样本研究更友好。很多临床科研拿到的生物样本获取难度高,样本总量有限,传统方法需要较高起始样本量,珍贵少量样本很难完成整套前处理。这套工具可以在样本起始量不高的条件下完成制备,对临床微量标本、少量细胞样本的蛋白组研究提供支持,帮助科研人员挖掘低样本量里面的蛋白信息,拓展临床样本的研究可行性。同时也可以适配高通量96孔板的批量处理,满足大规模队列样本处理需求。
  4,新耗材工具依旧需要完成实验室方法学验证,不能直接照搬参考流程。即便硬件耗材优化操作流程,不同样本基质,例如血浆、组织裂解液、细胞裂解物,成分差异较大,蛋白的理化性质各不相同。拿到工具之后,科研人员需要用自己的样本体系做条件调试,验证蛋白回收率、定量重复性,确认方法适配本实验室质谱仪器,再正式投入课题样本处理。
  蛋白组学的深度解析,质谱设备是下游,样品制备是上游的基础。优化前处理工具的意义,是减少人为操作引入的干扰,释放质谱仪器的分析能力,让更多低丰度蛋白信息能够被仪器捕捉,助力多组学课题挖掘样本内部生物学信息。

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